Les Etats-Unis sont sous la coupe du mutant Apocalypse et de son empire du plus fort. Les X-men, paria et resistant, sont dirigés par un Magneto mesuré et sage, reprenant le flambeau de son ami mort.
Nous sommes une dizaine d'année plus tard et le monde a tristement évolué. Les mutants, traqués sans relache par les sentinels ne sont plus qu'une poignée, tandis que les géants robotiques dirigent le monde d'une main de fer sous le contrôle de Nimrod, la sentinel prime.